Ergenekon davaları ve yargı tartışmalarıyla gündeme gelen isimler de 12 Haziran 2011 tarihinde milletvekili adaylığı için istifa etti. Eskişehir eski Emniyet Müdürü Hanefi Avcı'nın milletvekili aday adayı olabilmek için İçişleri Bakanlığı'na istifasını sunduğu öğrenildi. Sincan 1. Ağır Ceza Mahkemesi Başkanı Osman Kaçmaz MHP'den aday olmak için görevinden ayrıldı. Ergenekon soruşturmaları kapsamında yargılanan Adana Cumhuriyet Savcısı İlhan Cihaner de milletvekili aday adaylığı için görevini bıraktı. İlhan Cihaner'in genel seçimler için CHP'den milletvekili aday adayı olacağı iddia edildi. Yine Ergenekon soruşturması kapsamında tutuklanan ve ardından tutuksuz yargılanmak üzere serbest kalan Ankara Ticaret Odası Başkanı Sinan Aygün de CHP'den milletvekili aday adaylığı için görevinden istifa etti.