Sezon başında transferi konusunda Beşiktaş ile Fenerbahçe arasında krize neden olan, sonuçta Fenerbahçe'ye transferi gerçekleşen Mehmet Topuz, BJK İnönü Stadı'ndaki derbide belki de futbol kariyerinin en zor maçlarından birisine çıkacak. Transfer döneminde Mehmet Topuz'u renklerine katmak isteyen Beşiktaş ile Fenerbahçe karşı karşıya gelmişti. Beşiktaş, Mehmet Topuz'la, Fenerbahçe ise Kayserispor ile anlaşmıştı. Mehmet Topuz bu gelişmeler yaşanırken, Beşiktaşlı olduğunu ve siyah-beyazlı takımda forma giymek istediğini medya aracılığıyla kamuoyuna duyurmuş, hatta kaldığı otelde taraftarların verdiği Beşiktaş formasıyla verdiği pozlar yayınlanmıştı. Ancak daha sonra, bir gece yarısı operasyonuyla Fenerbahçe Başkanı Aziz Yıldırım, Mehmet Topuz'u özel uçakla İstanbul'a getirerek, Fenerbahçe Şükrü Saracoğlu Stadı'nda düzenlenen görkemli bir imza töreniyle sarı-lacivertli renklere bağlamıştı. 26 yaşındaki Mehmet Topuz bu sezon Fenerbahçe'de 9 lig maçında görev yaparken, 605 dakika sahada kaldı ve ligde henüz golle buluşamadı. Mehmet Topuz, sezon başında Beşiktaş ile yapılan TFF Süper Kupa maçında sakatlığı nedeniyle forma giyememişti.