Türkiye'nin yakından takip ettiği davalarda önemli görevler yapan Ali Fuat Yılmazer önemli açıklamalar yaptı. Başbakan Recep Tayyip Erdoğan'ın şike davasını önceden bildiğini söyleyen Yılmazer şöyle konuştu:
" Şike, istihbaratın şubenin işi değil. Organize şube, tesadüfi delil üzerine savcılık talimatıyla başladı. Aziz Yıldırım hangi bilgiyle şike davasını cemaate bağlıyor? Şike dosyası Organize şube çalışmasıdır. İstihbarat birimleriyle ilgisi yoktur. Sonradan haberimiz oldu. Şike dosyası Başbakana arz edildi.Memnun oldu. "Sağlam çalışın, operasyon için seçim sonrasını bekleyin" dedi. Şike dosyası suç delili üzerinden yürüdü. Herhangi bir camia hedef alınmadı."