İlk maçların 3 Nisan'da, rövanş karşılaşmalarının ise 10 Nisan'da oynanacağı çeyrek finalde, eşleşmeler şöyle gerçekleşti: Bayer Leverkusen (Almanya) - Zenit St Petersburg (Rusya) Glasgow Rangers (İskoçya) - Sporting Lizbon (Portekiz) Bayern Münih (Almanya) - Getafe (İspanya) Fiorentina (İtalya) - PSV Eindhoven (Hollanda) UEFA Kupası'nda yarı finalinde ise Bayern Münih-Getafe eşleşmesinin galibiyle Bayer Leverkusen-Zenit St Petersburg eşleşmesinin galibi, Glasgow Rangers-Sporting Lizbon eşleşmesinin galibiyle de Fiorentina-PSV Eindhoven eşleşmesinin galibi karşı karşıya gelecek. Yarı final ilk maçının 24 Nisan'da, rövanş karşılaşmasının ise 1 Mayıs'ta yapılacağı kupanın sahibi, 14 Mayıs'ta İngiltere'nin Manchester kentindeki final maçında belli olacak.