Bu sezon Avrupa mücadelesine UEFA Avrupa Ligi 3. eleme ve play-off turlarında yaptığı maçlarla başlayan, kendisine göre daha zayıf rakipler karşısında iki kez turu geçen sarı-lacivertliler, grup mücadelesindeki ilk maçında saha ve seyirci avantajını kullanamayarak mağlubiyetle tanıştı. Fenerbahçe için bu sezon öncelikli hedefin Turkcell Süper Lig şampiyonluğu olduğunu yaptığı açıklamalarda vurgulayan Daum yönetiminde bugüne dek 19 Avrupa kupası mücadelesine çıkan sarı-lacivertli takım, 6 maçı kazanırken, 10 yenilgi, 3 de beraberlik aldı. 2002-2003 sezonunda ligde 6. olduğu için 2003-2004 sezonunda Daum yönetiminde Avrupa kupalarına katılmayan Fenerbahçe, 2004-2005 sezonunda doğrudan katıldığı UEFA Şampiyonlar Ligi'nde 1. turdaki (D) Grubu'nda 3. oldu. Gruptan çıkamayan sarı-lacivertli ekip Avrupa kupalarına UEFA'da devam etti. İlk kez UEFA Kupası'nda 3. tur (32'ler turu) oynayan Fenerbahçe, İspanya'nın Real Zaragoza takımına elenmekten kurtulamadı. 2005-2006 sezonunda yine UEFA Şampiyonlar Ligi'ne doğrudan katılan sarı-lacivertliler, 1. turdaki (E) Grubu'nu son sırada tamamlayarak Avrupa'ya veda etti. 2009-2010 sezonunda ise UEFA Avrupa Ligi'nde 3. eleme ve play-off turu oynayan sarı-lacivertliler, ilk 4 maçında 2'şer galibiyet ve beraberlik aldı. Fenerbahçe, grup maçında Twente karşısında ise yenilgiden kurtulamadı. Sarı-lacivertlilerin, Christoph Daum yönetiminde çıktığı 19 Avrupa Kupası maçında aldığı sonuçların tablosu şöyle: SEZON O G B M A Y 2004-2005 Şampiyonlar Ligi 6 3 - 3 10 13 UEFA Kupası 2 - - 2 1 3 2005-2006 Şampiyonlar Ligi 6 1 1 4 7 14 2009-2010 UEFA Avrupa Ligi 5 2 2 1 11 6 TOPLAM 19 6 3 10 29 36 AA