Son olarak Arjantin'in Racing takımında forma giyen savunma oyuncusu Ayala, futbolu bıraktığını söyledi. Arjantin Milli Takımı'nda 137 kez forma giyen Javier Zanetti'nin ardından 115 maçla en çok forma giyen 2. oyuncu olan Ayala, milli takımda 7 gol attı. Futbola 1991'de Arjantin'in Ferro Carril Oeste takımında başlayan Ayala, 1994'de River Plate'e transfer oldu. Bir yıl sonra Napoli'ye transfer olarak Avrupa kariyerine başlayan Ayala, 1998'de Milan forması giymeye başladı. 2000 yılında İspanya'nın Valencia takımına transfer olan Ayala, 7 yıl formasını giydiği Valencia'da takımın gelmiş geçmiş en iyi savunma oyuncusu olarak gösteriliyordu. 2007-2010 yıllarında Real Zaragoza'da oynayan Ayala, Arjantin Milli Takımı ile 2004 Atina olimpiyatlarında altın madalya kazandı. Ayala'nın forma giydiği dönemde Milan 1999'da İtalya'da, Valencia da 2002 ve 2004'te İspanya'da şampiyon oldu.