Atletico Madrid kulübü ile Flores arasında yürütülen müzakereler olumlu sonuçlanırken, İspanyol teknik adamın birlikte çalıştığı tüm teknik kadroyla beraber bir yıl daha Atletico'da çalışması konusunda anlaşma sağlandığı açıklandı. Geçen sezon ekim ayı sonunda Abel Resino'nun yerine teknik direktörlüğe getirilen Flores, Atletico Madrid'e UEFA Avrupa Ligi kupasını kazandırırken, Kral Kupası'nda da final oynattı. Gelecek sezon Avrupa Ligi'nde mücadele edecek olan Atletico Madrid, Kun Agüero ve Forlan gibi önemli futbolcularını kadrosunda tutmak istiyor.