Kıbrıs'taki sorun nedeniyle NATO üyesi olan Türkiye, AB üyesi olan ancak NATO üyesi olmayan ülkelerle, ittifakın istihbarat paylaşmasını veto ediyor. Kosova ve Afganistan'da ortaklık yapan NATO ve AB'nin operasyonları bu durum nedeniyle sıkıntı yaşıyor. Fransa'da düzenlenen savunma konferansında konuşan Scheffer, "Askerlerimiz tehlikeli görevlerde omuz omuza mücadele ediyor. Bu şekilde devam edemez." dedi. Scheffer, sorunlardan birinin Avrupa Savunma Kurumu'na Türkiye'nin alınmaması olduğunu vurguladı. Konferans sonrası basının sorularını yanıtlayan Scheffer, "Türkiye'nin bu kuruma alınması için istekte bulundum." diye konuştu. Aynı konferansta konuşan AB Dış Politika ve Savunma Yüksek Temsilcisi Javier Solana, NATO Genel Sekreteri Scheffer'in çağrısına direk cevap vermezken sorunun aşılması gerektiğine dikkat çekmekle yetindi.