Filmin, yüzyıllar önce Maya uygarlığının büyük bir bölümüne ev sahipliği yapan Guatemala'da gösteriminden sonra yerli halk, "Apocalypto" filminin ırkçı olduğunu belirttiler. Yerli halk, ürkütücü bakışlara ve yaralı yüzlere sahip olduğu görülen Mayaların filmde, kültürleri gereği insanları kurban ettiklerini söylediler. Nahual Vakfının yöneticisi Ignacio Ochoa, filmde Mayaların, bölgeye Avrupalılar gelmeden önce birbirlerine vahşice davrandıkları ve bu nedenle kurtarılmaları gerektiği yönünde ırkçı ve saldırgan bir tutum izlendiğini söyledi. Gibson'un temsilcileri ise konuyla ilgili açıklama yapmadılar. Guatemala'nın Peten bölgesinde anıtsal kentler inşa eden Mayalar, 8. yüzyıldan sonra çökmeye başladı. Komşu Azteklerin aksine kan akıtmayı sevmeyen Mayaların son döneminde insanların kurban edilmesinin yaygın olduğu söyleniyor. Guatemala'nın nüfusunun yarısından fazlası Mayaların soyundan geliyor, bu kişiler ayrımcılıkla karşılaşıyor ve çoğu yoksulluk içinde yaşıyor. Ülkede 36 yıl süren iç savaş sırasında çoğu Maya kökenli 200 bin kişi ölmüştü.