1990'lı yıllarda işlenen faili meçhul cinayetlerle ilgili eski özel harekatçı Ayhan Çarkın'ın itirafları gündeme bomba gibi düşmüştü. Ardından eski MİT mensubu Mehmet Eymür'ün ifadesi alındı. Bu gelişmeler üzerine soruşturma savcısı MİT'ten bilgi, belge, tutanak ve doküman talebinde bulundu. İşte o beklenen dosyalar çok geçmeden savcılığa ulaştı. MİT'in savcılığa gönderdiği yazıda faili meçhul cinayetler ve yasadışı eylemlerle ilgili olarak, eski İçişleri Bakanlarından Mehmet Ağar, emekli albay Korkut Eken ve eski Özel Harekat Dairesi Başkanı İbrahim Şahin'in içinde yer aldığı oluşum anlatıldı. Dosyada "90'lı yıllarda devlet adına çalışan kişiler kendi çıkarları ve husumetleri için yasadışı yapılanmalar içerisinde bulunmuş, faaliyet göstermiştir." ifadelerine yer verildi. Yani MİT; bu açıklamalarıyla "Öldürdüğüm kişilerin yüzlerini her gece rüyamda görüyorum" diyen Ayhan Çarkın'ın ve Mehmet Eymür'ün soruşturmanın seyrini değiştirecek kritik ifadelerini doğruluyor. Ağar, Şahin ve Eken'i "Terör örgütü" yönetmekle suçluyor Faili meçhul cinayetleri araştıran savcılar Hakan Yüksel ve Mehmet Özgür eski özel harekat polisleri Ayhan Çarkın ve Ercan Ersoy'un tahliye taleplerine de itiraz etmişlerdi. İşte savcılar bu ititrazları ve MİT'ten gelen cevabi yazıları bir dosyada birleştirdi ve Ankara 12. Ağır Ceza Mahkemesi'ne sundu. 5 sayfalık mütalada MİT'ten gönderilen yazıların Çarkın ve Eymür'ün verdiği bilgilerle örtüştüğü vurgulandı; ayrıca somut delil taşıdığının da altı çizildi.