Stratejik Düşünce Enstitüsü tarafından Ağustos ayı YAŞ kararları öncesinde 'YAŞ ve Hükümet-TSK İlişkilerinin Yeniden Yapılandırılması' konulu bir rapor açıklandı. SDE Başkanı Prof. Dr. Yasin Aktay tarafından açıklanan raporda şu görüşlere yer verildi: - YAŞ sadece istişari bir kuruluş olarak kalmalı ve TSK'nın modernizasyonuna katkı sağlamalı. - YAŞ; terfi, atama, görev süresini uzatma ve TSK'dan ihraç görevi üstlenmemeli. - Bu işlemler Genelkurmay Başkanlığı ve Milli Savunma Bakanlığı üzerinden müşterek kararnamelerle yapılmalı. - YAŞ kararları ancak Cumhurbaşkanının onayıyla kesinlik kazanmalı. - YAŞ Kararları Yargı Denetimi'ne açık olmalı. - Ergenekon ve Balyoz davalarından tutuklu olup rütbelerinde bekleme sürelerini dolduran personelin emekli edilmesi, ancak tutuklu olduğu halde emekliliği gelmeyenlerin ise açığa alınması istendi. Tutuksuz yargılananların ise pasif göreve getirilmesi önerildi. - TSK soğuk savaş dönemi koşullarına göre olan mevcut yapısının günün koşullarına göre tekrar gözden geçirilmesi öngörüldü. Askeri personel sayısındaki anormal fazlalık olduğu bildirildi. - Genelkurmay'ın Savunma Bakanlığı'na bağlanması, kuvvet komutanlıklarının ise Genelkurmay içinde birimlere dönüştürülmesi gerektiği belirtildi. - Terfide performans faktörleri öncelikli olmalı, aşırı general ile amiral sayısında azaltmaya gidilmeli. - Jandarma emniyete benzer bir yapıda profesyonelleşmeli. - Askeri Yüksek İdare Mahkemesi ve Askeri Yargıtay kaldırılmalı. - Askeri mahkemeler sadece disiplin suçlarına bakan bir yapıya kavuşturulmalı.