Makedon asıllı olan Alili, 11 Ağustos 2009'da İstanbul Emniyeti Yabancılar Şubesi Müdürlüğü tarafından gözaltına alınmış ve Bayrampaşa'daki evinde arama yapılmıştı. Alili'nin Ergenekon davasının tutuklu sanıklarından Doğu Perinçek ve Erol Manisalı gibi şahıslarla ilişkisi olduğu gerekçesiyle Ergenekon savcılarının talimatıyla Terörle Mücadele Şube Müdürlüğü'ne (TEM) gönderilmişti. Alili, TEM'deki işlemlerinin tamamlanmasından sonra Beşiktaş'taki İstanbul Adliyesi'ne sevk edildi. Burada Ergenekon soruşturması kapsamında savcı Zekeriya Öz'e ifade verdikten sonra serbest bırakıldı. Ancak Türkiye'de kaçak bulunduğu gerekçesiyle adliye çıkışı polis ekipleri tarafından tekrar İstanbul Emniyeti Yabancılar Şube Müdürlüğü'ne götürüldü. Emniyet yetkililerinden alınan bilgiye göre Makedon uyruklu olan Alili, İçişleri Bakanlığı'nda süren işlemlerin tamamlanmasından sonra sınır dışı edilecek. Alili, halen İstanbul Emniyeti Kumkapı Yabancılar Şubesi misafirhanesinde tutuluyor. Arnavut düşmanlığı yaptığı gerekçesiyle bir Arnavut vatandaş tarafından ihbar edilen Alili'nin Türkiye'de kaçak olarak yaşadığı ve ülkesi Arnavutluk'ta da asker kaçağı olduğu tespit edilmişti. Alili'nin annesinin de Türkiye'de kaçak yaşadığı iddia ediliyor. Ergenekon 1. iddianamesinde Teoman Alili'nin Ergenekon tutuklu sanıklarından İşçi Partisi Başkanı Doğu Perinçek'le yazışmaları yer alıyordu. İddianamede Alili'nin Perinçek'in emirlerini yerine getirdiği görülüyor.