Amirallere Suikast İddianamesi'nde adları özel görevler için kullanılacaklar listesinde yer alan bazı teğmenlerin, Ergenekon sanıkları ile çok yakın temas halinde oldukları görülüyor. Teğmen F.O'nun, kamuoyunda "ölme ve öldürme yemini" ile tanınan Ergenekon sanığı emekli albay Fikri Karadağ ile bağlantılı olduğu anlaşılıyor. Yasadışı yapılanmanın teğmenlerden biriyle ilgili tuttuğu notta Ergenekon faaliyetlerini Askeri birlik içinde sürdürdüklerine dikkat çekiliyor. Listede, Ergenekon sanığı Şener Eruygur'un o dönem başında olduğu Atatürkçü Düşünce Derneği de var var. Teğmen T.A'nın ADD tarafından yetiştirildiği yazıyor. Ergenekon tutuklu sanıklarından Doğu Perinçek'in İşçi Partisinde aktif görev aldıkları da öne sürülen Teğmenlerin, Ergenekon'un organize ettiği iddia edilen mitinglere de katılmışlar. Sanıklardan, iddia edilen ETÖ'nün ana belgelerinden olduğu öne sürülen çeşitli belgelerin çıkması da aradaki irtibatı güçlendiriyor.