Gölcük Donanma Komutanlığı'nda 6 Aralık 2010'da yapılan aramada ele geçirilen belgelerde yakın tarihe ışık tutacak çarpıcı bilgiler de ortaya çıktı. İkinci Balyoz davasının ek klasörlerinde 28 Şubat'a zemin hazırlamakla görevli Batı Çalışma Grubu'na ait evrakların imha edildiğini gösteren dokümanlar var. 'BÇG İMHA TUTANAĞI1.doc' isimli belgede, 81 kalem fişleme, takip dokümanları ve raporlar tek tek sayılarak tutanak altına alınmış. Tutanakta imha eden isim askerî casusluk davası tutuklu sanığı İstihbarat Binbaşı Kemalettin Yakar görünüyor. İmha onayını veren ise Tümamiral Bülent Bostanoğlu. Tutanağa göre, 1 Mayıs 1997'den 5 Şubat 2003'e kadar çeşitli tarihlerde hazırlanmış dokümanlar yok edilmiş. Buna göre Balyoz darbe planı davası tutuklu sanığı emekli Orgeneral Çetin Doğan'ın kurduğu ve 6 ay başında kaldığı Batı Çalışma Grubu'nun 2003 yılına kadar faaliyet gösterdiği de anlaşılıyor. Tutanağın hangi tarihte imha edildiğine ilişkin bir ibare yok ancak Yakar'ın İstihbarat Karşı Koyma biriminde göreve başlamasından sonra yapıldığı anlaşılıyor. 1997-2003 yılları arasına ait evrakların 2007 yılından sonraki bir talimatla imha edildiği görülüyor. İmha edilen belgeler arasında, 1 Mayıs 1997 tarihli 'Batı Çalışma Grubu Rapor Sistemi', 5 Mayıs 1997 tarihli 'Batı Çalışma Grubu bilgi ihtiyaçları', 29 Nisan 1997 tarihli 'Laiklik Aleyhtarı Hareketler', 30 Mayıs 1997 'Batı Eylem Planı', 24 Şubat 1998 'Batı Çalışma Grubu Faaliyetleri' ve 27 Ağustos 1997 'İrticai Unsurlarla İlişkili Okul ve Tersaneler', 28 Haziran 1998 'Fethullah Gülen'in TSK Hakkında Verdiği Talimatlar' ve 6 Mayıs 1993 tarihli 'Rapor' gibi başlıklar yer alıyor.