Çankaya Köşkü'nde gerçekleştirilen MGK toplantısı 4,5 saat sürdü. Milli Güvenlik Kurulu (MGK) toplantısında, Avrupa Birliği'ne (AB) katılım sürecinin ulusal yararlar doğrultusunda kararlı bir şekilde yürütüleceğinin teyit edildiği bildirildi. MGK'nın, Cumhurbaşkanı Ahmet Necdet Sezer'in başkanlığındaki olağan toplantısından sonra MGK Genel Sekreterliğinden konuya ilişkin yapılan yazılı açıklamada, toplantıda, ülke güvenliği yönünden iç ve dış gelişmelerin kapsamlı bir değerlendirmesinin yapıldığı, terörle mücadelenin sürdürülmesinin öneminin vurgulandığı ifade edildi. Açıklamada, şöyle devam edildi: ''Filistin Ulusal Yönetimi ve İsrail'de gerçekleştirilen genel seçimler çerçevesinde Ortadoğu'da mevcut durum değerlendirilmiş, ilgili tarafların şiddeti tırmandırabilecek adımlardan kaçınmalarının ve müzakereleri başlatmak için elverişli siyasi ortamın tesis edilmesinin gerekliliği, sorunların görüşmeler yoluyla çözülmesini sağlamak için, ülkemizin her iki tarafla geliştirdiği özel ilişkileri sürdürmeye ve Filistin halkının içinde bulunduğu olumsuz yaşam koşullarının iyileştirilmesine yönelik yardım faaliyetlerimizin devam ettirilmesinin önemi üzerinde durulmuştur. AB'ye katılım müzakerelerinin 3 Ekim 2005 gününde açılmasını takiben, 35 konu başlığı altında yürütülmekte olan tarama süreci ve 12 Haziran 2006 günü başlayan üyelik müzakere aşaması değerlendirilmiş, AB'ye katılım sürecinin ulusal yararlarımız doğrultusunda kararlı bir şekilde yürütüleceği teyit edilmiştir. Ortak bir Avrupa sahası düzenlenmesine yönelik bir yaklaşım olan Tek Avrupa Hava Sahası Projesinin amacı, temel prensipleri ve ülkemize olan etkileri ile söz konusu projeye yönelik uyum çalışmaları ele alınmış ve Tek Avrupa Hava Sahası'na katılım konusunda ilgili kurumlartarafından alınacak önlemler değerlendirilmiştir.'' Açıklamada, toplantıda ayrıca, sağlık politikası çerçevesinde ulusal hedef ve stratejiler, sağlıkta dönüşüm programı kapsamında gerçekleştirilen faaliyetler ile Doğu ve Güneydoğu Anadolu Bölgesinde sağlık alanında yapılan çalışmaların ele alındığı kaydedildi. Öte yandan, toplantıya gündem konuları nedeniyle Devlet Bakanı ve Başmüzakereci Ali Babacan, Ulaştırma Bakanı Binali Yıldırım ve Sağlık Bakanı Recep Akdağ da bir süre katıldı.