3. Ağır Ceza Mahkemesi, 13 Şubat 2006 tarihinde dava dosyası hakkında görevsizlik kararı verilerek, dosyayı Diyarbakır 7. Kolordu Askeri Mahkemesi'ne göndermişti. Mahkeme, kararının gerekçesinde, sanıklar hakkındaki iddianamede, gerekçesini savcının esas hakkındaki mütalaasına dayandırdı. Kararın, ''Cumhuriyet Savcısının esas hakkındaki mütalaası'' bölümünde şöyle denildi: ''Savcı esas hakkındaki mütalaasında, sanıkların suç tarihinde Jitem görevlisi olduklarının anlaşıldığını, Jitem'in jandarma istihbaratına bağlı olarak faaliyette bulunduğunu, sanıkların bu durumda suç tarihinde askeri şahıslar olduklarını, asker şahısların işlemiş oldukları suçlardan dolayı askeri mahkemede yargılanmalarının gerektiğini ve dosyanın bu kanaate varılmakla görevsizlik kararı verilerek Diyarbakır 7. Kolordu Askeri Mahkemesi'ne gönderilmesine karar verilmesini kamu adına talep etmiştir.'' Kararda, tüm sanıkların eylemleri bakımından üzerlerine atılı suçlardan mahkemenin görevsizliğine ve dosyanın 353 sayılı Askeri Mahkemelerin Kuruluş ve Yargılama Usulü Hakkındaki Kanun'un 9 ve 10. maddeleri uyarınca yetkili ve görevli Diyarbakır 7. Kolordu Askeri Mahkemesi'ne gönderilmesine karar vermek gerektiği sonuç ve kanısına ulaşıldığı kaydedildi. Mahkeme, oy birliğiyle verdiği kararda, yargılamanın yapılması için dava dosyasını 7. Kolordu Askeri Mahkemesi'ne gönderdi. İddianamede, çeşitli tarihlerde Diyarbakır, Mardin ve Batman'da öldürme, kundaklama, bombalama eylemlerini gerçekleştirdikleri belirtilen 11 sanığın TCK'nın 313. maddesi uyarınca, 'cürüm işlemek için teşekkül oluşturmak' ve 450. maddesi uyarınca 'Birden fazla kişiyi öldürmek' suçlarından 9'u hakkında müebbet, 2'si hakkında da 15 yıla kadar hapis cezası isteniyor.