İkinci iddianamede, 12 kişi için örgüt yöneticiliği suçlaması yapılıyor. 12 kişi arasında emekli orgeneraller Şener Eruygur ve Hurşit Tolon da var. İddianamede yer alan 56 kişi arasında 12 kişi diğer suçlamaların yanı sıra Ergenekon'da örgüt liderliği suçlamasıyla yargılanacaklar. İddianamede 2007 yılında düzenlenen Cumhuriyet mitingleri ile hükümetin demokratik olmayan yollardan düşürülmeye çalışıldığı belirtiliyor. İddianamede ayrıca PKK ile Ergenekon ilişkisi üzerinde duruluyor. İDDİANAME 5 BÖLÜMDEN OLUŞUYOR - Birinci bölüm, Ergenekon soruşturmasının ilk aşamasıyla birinci iddianamenin özetini içeriyor. - İkinci bölümde soruşturmanın sonraki aşamaları ve Ergenekon örgütü anlatılıyor. - Üçüncü bölümde “örgütün işlediği suçların genel olarak ve topluca anlatılıyor. - Dördüncü bölümde örgütün diğer faaliyetleri, başka örgütlerle sivil toplum ve medya kuruluşlarıyla ilişkiler yer alıyor. - Beşinci bölümde ise iddianamede yazılı şüphelilerin bireysel eylemleri ve bu eylemlerin oluşturduğu suçlar ve sevk maddeleri ile hukuki durumlar işleniyor. İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığından yapılan yazılı açıklamada, 12 Haziran 2007'de başlatılan ve müteakip tarihlerde genişletilerek sürdürülen soruşturmayla ilgili olarak 10 Temmuz 2008'de açılan birinci kamu davasından sonra sürdürülen soruşturmanın ikinci aşamasının tamamlandığı anlatıldı. 2. iddianamede 21 tutuklu, 35 tutuksuz olmak üzere 56 şüpheli olduğu ifade edilen açıklamada, yakın tarihlerde soruşturmaya dahil edilen 48 tutuklu, 29 tutuksuz olmak üzere 77 şüpheli hakkındaki soruşturma evrakının tefrik edildiği ve bunlar hakkındaki soruşturmanın devam ettiği kaydedildi. Toplam 1909 sayfalık iddianamenin 5 bölümden oluştuğu belirtildi. Birinci bölümde, ''Ergenekon'' soruşturmasının ilk aşamasıyla birinci iddianamenin özetinin yapıldığı, ikinci bölümde soruşturmanın sonraki aşamaları ve ''Ergenekon'' örgütünün anlatıldığı dile getirilen açıklamada, üçüncü bölümde ''örgütün işlediği suçların genel olarak ve topluca anlatıldığı, dördüncü bölümde örgütün diğer faaliyetleri, başka örgütlerle sivil toplum ve medya kuruluşlarıyla ilişkilerinin yer aldığı, beşinci bölümde ise iddianamede yazılı şüphelilerin bireysel eylemleri ve bu eylemlerin oluşturduğu suçlar ve sevk maddeleri ile hukuki durumlarının işlendiği'' bildirildi. Açıklamada, şüpheliler hakkındaki suçlara ilişkin şu bilgilere yer verildi: ''2 şüpheli hakkında 'örgüt yöneticisi olmak', 'cebir ve şiddet kullanarak TBMM'yi ve Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevlerini yapmasını kısmen veya tamamen engellemeye teşebbüs', 'Türkiye Cumhuriyeti hükümetine karşı silahlı isyana tahrik', 'devletin güvenliğine veya iç veya dış siyasal yararlarına ilişkin belgelerini kullanmak', 'devletin güvenliğine ilişkin belgeleri temin etmek', 'kişisel verileri hukuka aykırı olarak kaydetmek', 'adil yargılamayı etkilemeye teşebbüs suçlarından' ve örgütün üst düzey yöneticileri olduklarından yasa gereği örgüt üyelerinin işledikleri suçlardan, 2 şüpheli hakkında 'örgüt yöneticisi olmak', 'cebir ve şiddet kullanarak TBMM'yi ve Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevlerini yapmasını kısmen veya tamamen engellemeye teşebbüs', 'Türkiye Cumhuriyeti hükümetine karşı silahlı isyana tahrik', 'devletin güvenliğine veya iç veya dış siyasal yararlarına ilişkin belgelerini kullanmak', 'devletin güvenliğine ilişkin belgeleri temin etmek', 'kişisel verileri hukuka aykırı olarak kaydetmek', 'resmi evrakta sahtecilik' suçlarından, 4 şüpheli hakkında, 'örgüt yöneticisi olmak', 'cebir ve şiddet kullanarak TBMM'yi ve Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevlerini yapmasını kısmen veya tamamen engellemeye teşebbüs', 'askeri itaatsizliğe teşvik', 'kişisel verileri hukuka aykırı olarak kaydetmek', 'adil yargılanmayı etkilemeye teşebbüs' suçlarından, 1 şüpheli hakkında 'örgüt yöneticisi olmak', 'kişisel verileri hukuka aykırı olarak kaydetmek' suçlarından, 3 şüpheli hakkında 'örgüt üyesi olmak', 'cebir ve şiddet kullanarak TBMM'yi ve Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevlerini yapmasını kısmen veya tamamen engellemeye teşebbüs', 'devletin güvenliğine ilişkin belgeleri temin etmek', 'patlayıcı madde bulundurmak', 'yasaklanan bilgileri temin etmek' suçlarından, 3 şüpheli hakkında 'örgüt yöneticisi olmak', 'Türkiye Cumhuriyeti hükümetini ortadan kaldırmaya veya görevlerini yapmasına kısmen veya tamamen engellemeye teşebbüs' suçlarından, 37 şüpheli hakkında 'örgüt üyesi olmak', 'yasaklanan bilgileri temin etmek', 'kişisel verileri hukuka aykırı olarak kaydetmek', 'uyuşturucu madde bulundurmak', '6136 sayılı yasaya muhalefet' suçlarından, 4 şüpheli hakkında 'örgüte bilerek ve isteyerek yardım etmek' suçlarından kamu davası açılmıştır.'' Açıklamada, yasa gereği iddianame, mahkeme tarafından kabul edilinceye kadar soruşturmanın içeriğiyle ilgili gizlilik kuralının devam ettiği vurgulandı.