Rapora göre, Avrupa Konseyi Kalkınma Fonu'ndan gelen 96 milyon dolar, Ergenekon sanığı Haberal'ın vakfı bünyesindeki 12 şirketin kasasında. Bankacılık Düzenleme ve Denetleme Kurumu (BDDK) murakıpları, Başkent Üniversitesi üzerinden yapılan kredi usulsüzlüklerini tek tek ortaya çıkardı. Üst Kurul'un İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı'nın talebi üzerine hazırladığı rapora göre, Ergenekon davasının tutuklu sanığı eski Başkent Üniversitesi Rektörü Mehmet Haberal, Avrupa Konseyi Kalkınma Fonu'ndan kullandırılan yaklaşık 96 milyon dolar krediyi belli periyotlarla Haberal Eğitim Vakfı bünyesinde kurulan 12 şirkete aktardı. İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı, CMK'nın 250. maddesi kapsamında Mehmet Haberal'ın kurucu rektörü olduğu Başkent Üniversitesi ve şirketleri arasındaki para akışını ortaya çıkarmak için BDDK'dan inceleme istedi. Üst Kurul'un 4 murakıbının bir yıl süren araştırması Başkent Üniversitesi ve ilgili şirketler arasındaki para trafiğini gözler önüne serdi. İncelemelere göre Haberal, üniversite adına yurtdışından milyonlarca dolar kredi alırken garantörlüğü de Hazine Müsteşarlığı üstlendi. Rapora göre Haberal, Avrupa Konseyi Kalkınma Fonu'ndan 21 Nisan 1995'ten itibaren belli aralıklarla 25 milyon dolar, 36 milyon 596 bin, 10 milyon, 7 milyon, 5 milyon, 7 bin 750 bin ve son olarak da 5 milyon dolar olmak üzere toplam 96 milyon 346 bin dolar kredi kullandı. Bu kredilere de Hazine Müsteşarlığı'nca Halk Bankası hem garantör hem de aracı oldu. Fon'dan dolar bazında kredi alınmasına rağmen kurumlar, Başkent Üniversitesi'yle TL bazında anlaşmaya imza attı. Rapora göre, kullandırılan kredilere ilişkin geri ödemeler kurum tarafından gerçekleştirilmemiş, anapara ve faiz ödemeleri de ertelenmiş ve yeniden yapılandırılmış. İncelemeler, 25 milyon dolar karşılığı TL olarak kullandırılan 1 Nisan 1998, 1 Ekim 1998, 1 Ekim 1999, 1 Nisan 2000 ve 1 Ekim 2010 vadeli faiz ve taksitlerin de Başkent Üniversitesi tarafından ödenmediğini ortaya çıkardı. Benzer şekilde 36 milyon 596 bin dolarlık kredinin de 1 Temmuz 1998'de başlamak üzere 1 Ocak 2002 vadeli faiz ve taksitlerin ödenmediği rapora yansıdı. 25 milyon ve 36 milyon 596 bin dolarlık krediler ise Kalkınma Fonu'ndan dolar cinsinden alınmasına karşın, Hazine, Haberal'dan bu kredileri TL bazında ödeme kararı alması dikkat çekiyor. Ayrıca TL'nin değer kaybetme riski de (kur riski) Hazine tarafından üstlenilmiş. BDDK murakıpları, Başkent Üniversitesi ile Haberal'ın şirketleri arasında para akışı tespit etti. Üst Kurul'un raporuna göre Başkent Üniversitesi bünyesinde pek çok şirket kurulurken, bu şirketlerin tamamında yönetim kurulu başkanlığı veya şirketi temsil yetkisine haiz yönetici görevini Haberal yürütüyor. Raporda, üniversite hesabından ilgili şirketlere milyonlarca TL para aktarıldığı ifade ediliyor. Haberal Eğitim Vakfı'nın hesabına 12 Nisan 2005- 1 Aralık 2008 tarihleri arasında, kurumun şirketleri tarafından bağış adı altında toplam 152 bin 395 lira gönderilmiş. Türkiye Organ Nakli ve Yanık Tedavi Vakfı'nın Halk Bankası'ndaki hesabına ise 20 Temmuz 2005-12 Aralık 2008 tarihleri arasında 50 bin 750 lira aktarıldığı rapora yansıdı. Yine vakfın Vakıfbank'taki hesabına ise 18 Mart 1999- 10 Mayıs 2002 tarihleri arasında da Başkent Üniversitesi ve üniversitenin hakim olduğu ortak şirketler tarafından 40 bin 528 liralık bir miktarın yatırıldığı anlaşıldı. Murakıplar, üniversitenin kurucu iki vakfının pek çok şirketle de ortaklığı olduğunu ortaya çıkardı. Üniversite hesabından ilgili şirket hesabına yapılan ödemeler şöyle: Anıt Sağlık'ın İş Bankası'ndaki hesabına Başkent Üniversitesi'nce 18 Aralık 2007-6 Mayıs 2009 tarihleri arasında 119 bin 783 lira, şirketin aynı bankanın diğer bir şubesine 7 Ekim 2004-2 Nisan 2007 tarihleri arasında 592 bin 980 lira, Akbank hesabına 260 bin, Fortisbank'a 940 bin lira, Vakıfbank'a 12 Temmuz 2002-4 Ocak 2006 arasında 4 milyon 681 bin 445 lira, ayrıca Başkent Üniversitesi Geliştirme Vakfı tarafından da 13 Mart 2003-1 Mayıs 2008 arasında 2 milyon 414 bin 721 lira. Yine Başkent Üniversitesi tarafından Başkent Grup Sağlık Ürünleri hesabına ilk olarak 496 bin olmak üzere belli aralıklarla 289 bin, 20 bin, 1 milyon 748 bin ve son olarak 375 bin TL para aktırıldı. 'Tenis ve plates' adı altında hesaba para gönderilmiş BDDK murakıpları, Başkent Üniversitesi hesabından Otidaş'a 10 Ocak 2005-9 Mart 2009 tarihleri arasında 451 bin 826 lira, Alaf Konfeksiyon Tasarım'a 7 Ocak 2008-5 Mayıs 2009 tarihlerinde 821 bin lira, bu şirketin başka banka hesabına 40 bin liranın gönderildiğini tespit etti. Mol Petrol Akaryakıt ve Dinlenme Tesisleri hesabına 31 Ağustos 2004-14 Aralık 2007 arasında 2 milyon 330 bin 378 lira para yatırılırken, 'Başkent Üniversitesi' açıklamasıyla 3 milyon 244 bin 484 TL aktarım yapıldı. İş Bankası'ndaki diğer hesaplarına 10 milyon 65 bin lira, Akbank'a ise 8 Mart 2007-5 Aralık 2008 döneminde 7 milyon 375 bin 600 lira yatırıldı. Halk Bankası hesabına 2 milyon 325 bin 217 lira ödeme yapıldığı rapora yansıdı. Aküm Reklamcılık'ın hesabına 1 milyon 53 bin TL aktarılırken, Başkent Üniversitesi Geliştirme Vakfı hesabına 342 işlemle 666 bin 165, 87 işlemle 177 bin 457, ayrıca başka bir banka hesabına 1 milyon 730 bin lira aktarıldığı belirlendi. Yine aynı hesaplara tenis ve plates ücreti gibi açıklamalarla da muhtelif şahıslar tarafından para akışı yapıldığı raporda işaret edilen diğer rakamlar.