Ergenekon Davasında iddianamenin açıklanmasından itibaren belli çevrelerden gelen dezenformasyon da gecikmedi. Eski Yargıtay Savcısı Ahmet Gündel, Ergenekon Davası'nı Samanyolu Haber'e yorumladı. İddianamede büyük yer tutan telefon kayıtları savcılık izniyle gerçekleştiği için delil niteliği taşıyor. Gündel, savcılık izniyle ele geçirilen delillerin kabul edilemez gösterilmeye çalışılmasını "yanlış kamuoyu oluşturuluyor" şeklinde açıklıyor. Davada en kritik konulardan biri de gizli tanıklar. Bazı çevrelerin tanık koruma kanunu çerçevesine girmeyeceğini savundukları gizli tanıklarla ilgili Eski Yargıtay Savcısı’nın önemli bir tespiti var: “Tanık Koruma Kanunu kapsamında gizli tanık önemlidir. Terör davalarında önemlidir. Ama korunması da gerekir. Çünkü terör örgütleri acımasızdır” Eski Yargıtay Savcısı Gündel, baştan beri davayı yönlendirme girişimlerinde dikkat çekiyor. Gündel'in önemli bir çağrısı daha var. “Dava ile ilgili kimse konuşmamalıdır, suçtur. Yargıçları rahat bırakın” Bu tip terör davalarında uzun süren bir çalışma sonucu kapsamlı bir iddianame ortaya çıkmasını "bu her zaman böyle olmuştur " diye açıklayan Eski Yargıtay Savcısı, Ak Parti'ye açılan kapatma davasının, Ergenekon Davası'nı nasıl etkileyeceği noktasında ise kritik bir tespitte bulundu. “Son bağlantılarla ilgili hükümetin ciddi destekleri var. Hükümet marifetiyle önemli mesafeler kat edildi. Ak Parti'ye bir kapatma kararı çıkarsa dava sağlıklı bir şekilde sürmez.”