Örgütün 2005 yılı için yaptığı sıralamada 65. sırada olan Türkiye, 2006 yılında 60. sıraya yükseldi. Uluslararası Şeffaflık Örgütünün bu yılki raporu özel olarak hukuk ve adalet sistemindeki yolsuzluklar üzerinde odaklandı. Raporun Türkiye ile ilgili bölümünde, cumhuriyetin ilk 60 yılında yargı sisteminde görece düşük kalan yolsuzluk algısının son 20 yılda yükselmeye başladığı vurgulanarak, bunun yargı kurumuna kamuoyunda duyulan güvenin aşınmaya başladığının işareti olduğu öne sürüldü. Raporda, yargı sisteminin siyasal müdahalelere açık kıldığı savunulurken, hakim ve savcı dokunulmazlığının da kötüye kullanılabildiği iddia edildi. Uluslararası Şeffaflık Örgütünün raporunda, Türk yargı sistemini yolsuzluklara açık kılan bir başka unsur olarak da bilirkişi kurumu gösterildi. Raporda, bilirkişi raporlarının çoğu durumda, yanlış, yanıltıcı ve sahte olduğu, ancak, teknik bilgi gerektiren konularda bilirkişi görüşüne başvuran Türk akimlerinin bilirkişi raporlarını genellikle sorgulamadan kabul ettiği ifade edildi. AA