Hrant Dink 19 Ocak 2007'de öldürüldü. O dönemde Ergenekon henüz bilinmiyordu. Dava dört yıl sürdü. Hala da devam ediyor. Neredeyse karar aşamasına gelindi. Ancak herkes davada eksik birşeylerin olduğunu söylüyordu. İşte o eksik Pazartesi günü giderildi. Duruşma savcısı Hikmek Usta Ergenekon'un altını çizdi. Balyoz ve Kafes'te Hrant Dink'in hedef alındığına dikkat çekti. Rahip Santaro, Zirve Yayınevi cinayetlerini de aynı kapsamda ele aldı. Ergenekon'un bu cinayetlerden operasyon diye bahsettiğini aktardı. Deliller arasında Ergenekon davası sanıklarından Ümit Sayın'ın Adli Tıp Enstitüsü Müdürü Sevil Atasoy'la yaptığı MSN görüşmesi de var. O kayıtlarda Sayın, "Hrant Dink, bizim savaştığımız adam " cümlesi yazıyordu. Savcı, mütalasında cinayetin Ergenekon tarafından işlendiğini gösteren delillere yer verdi. Savcı, tetikçiyi yönlendiren Yasin Hayal'in bir papazı dövmesi ile Zirve cinayeti sanığı Emre Günaydın'ın misyonerlerin arasına sızmasının benzer eylemler olarak değerlendirdi. Ayrıca kendilerine Vatansever Kuvvetler Güç Birliği diyen gruba üye bir şahsın telefon görüşmelerinde "Cinayeti bizimkiler yaptı" sözleri de deliller arasında bulunuyor. Savcı bu cümleden kastedilenin de Ergenekon olduğunu söylüyor.