Soruşturmayı yaklaşık 4 yıldır yürüten Selim Berna Altay'ın kendi talebi üzerine özel yetkilerinin kaldırılmasının ardından dosya Savcı Muammer Akkaş'a verildi. Akkaş, İbrahim Tatlıses'e suikast soruşturmasını da yürütüyor. Gazeteci Hrant Dink'in öldürülmesine ilişkin soruşturmaya yeni savcı atandı. Cinayetin işlendiği 19 Ocak 2007'den beri soruşturmayı yürüten savcı Selim Berna Altay'ın kendi talebi üzerine özel yetkileri kaldırılarak Çağlayan'daki adliyede görevlendirilmişti. Bu tayinin ardından Dink cinayeti soruşturmasını artık savcı Muammer Akkaş yürütecek. Akkaş, halen İbrahim Tatlıses'e yönelik silahlı saldırı soruşturmasını da yürütüyor. Dink cinayetiyle ilgili davada karar aşamasına gelinirken devam eden soruşturmada ise geçtiğimiz Nisan ayından Erhan Özen tanık olarak ifade vermişti. Özen ifadesinde JİTEM'e çalıştığını, 2004 yılında Ergenekon davasının tutuklu sanığı Sevgi Erenerol'un talimatıyla Dink'i yabancı mezarlığına götürdüklerini, Dink ile Erenerol'un yarım saat bir aracın içinde görüştüğünü söylemişti. İfadesinde Dink'in mezarlıkta tehdit edildiğini belirten Özen, "Muzaffer Tekin'den aldığım talimatla 2005 yılında Agos gazetesi önünde fotoğraflama için görevlendirildim. Adıma kayıtlı araçla gazete çevresinde fotoğraf çektim. Bu fotoğrafların bir kısmını bir ekmek fabrikasında sakladım." demişti.