Savcılar, iddianamede, toplantının, Dönemin Kara Kuvvetleri Komutanlığı'nın emirlerine aykırı olarak yapıldığına dikkat çektiler. Kara Kuvvetleri Komutanlığı'nın gözlemci raporuna göre, toplantıda öncelikli başlık "iç tehdit"ti. Savcılığın değerlendirmesinde, AK Parti iktidara gelince seminerin, "Darbe planı" olarak değiştirildiği ifade ediliyor. Bütün komutanların darbe planını bilerek, hazırlıklı bir şekilde toplantıya katıldıkları vurgulanıyor. İddianamede, Emekli Orgeneral Çetin Doğan'ın, 28 Şubat etkisinin kaybolacağı düşüncesiyle darbe planladığı ifade ediliyor. Hatta bunun için, dönemin Harp Akademileri Komutanı Emekli Orgeneral İbrahim Fırtına ve Donanma Komutanı Emekli Oramiral Özden Örnek'le anlaşmaya varıldığı öne sürüldü.