Soruşturma çerçevesinde ele geçirilen belgelerde, cenaze törenlerinin hükümeti yıpratmak için istismar edildiğini gösteren çok sayıda örnek bulunuyor. Bunlardan en çarpıcı olanı ise Mersin'deki şehit cenazesinde yaşandı. Telefonda 'ortalığı yıkıyoruz' diyen Vatansever Kuvvetler Güç Birliği üyesine, arkadaşı 'Çok güzel, basın var mı?' diye soruyor. Son dönemlerde art arda gelen şehitler için yapılan cenaze törenleri, organize eylemlere sahne oluyor. Hükümeti yıpratmak için milletvekili ve bakanlara yönelik fiilî saldırılarla, bir yandan da Türk-Kürt çatışması kışkırtılıyor. Kritik süreçlerde sahneye konulan bu çirkin tezgâha, Ergenekon iddianamelerine giren belgeler ışık tutuyor. Temmuz 2008'de gözaltına alınan İşçi Partisi Öncü Gençlik Kolları İstanbul İl Başkan Yardımcısı Tunç Akkoç'tan çıkan notlarda, şehit cenazelerinin kullanılmasının önemine işaret ediliyor. Ergenekon sanığı emekli Tümgeneral Erdal Şenel'in evinde bulunan bir CD'deki 'Karanlık Savaş Konsepti 2' başlıklı dokümanda da "Terörün açıktan lanetlenmesi ancak el altından desteklenmesi." ifadeleri yer alıyor. Vatansever Kuvvetler Güç Birliği Hareketi hakkındaki iddianamede ise Mersin'deki cenaze töreninde yaşanan provokasyon deşifre ediliyor. "Ortalığı yıkıyoruz, akşam haberlerde izlersin." diyen M.Sezer'e telefondaki A. Cinali isimli şahıs şöyle soruyor: "Çok güzel, basın var mı?" Önemli dönemeçlerde art arda şehit verilmesi ve şehit cenazelerinin tahrik malzemesi olarak kullanılması, dikkatleri Ergenekon soruşturmasında ele geçirilen belgelere çekti. Soruşturma kapsamında ele geçirilen belgeler, yaşananlara ilişkin önemli ipuçları veriyor. Temmuz 2008'de gözaltına alınan İşçi Partisi Öncü Gençlik Kolları İl Başkan Yardımcısı Tunç Akkoç'ta "Genel Kongre Raporu Taslağı Şubat 2008" isimli bir doküman çıktı. "22 Temmuz (2007) seçimleriyle gücünü tazeleyen AKP'ye karşı kuvvetlerin giderek daha kararlı olma zorunluluğu"nun olduğu belirtilen dokümanda şöyle deniliyor: "Seçimler öncesinde gerçekleştirilen Cumhuriyet mitinglerinin başarısı, yine gerçekleşen terör eylemleri sonucu organize edilen mitingler ve şehit cenazelerindeki eylem tarzının doğruluğunu ve başarısını... Yine Öncü Gençlik yapılanması olarak liseler ve üniversitelerde gerçekleştirilen kadrolaşma çalışmalarının maddî kaynakları artırma girişimlerinin açıklandığı toplantı kararları ve değerlendirmesinden müteşekkil olduğu görülmüştür." Ergenekon sanıklarından Erdal Şenel'de bulunan Türk Silahlı Kuvvetleri'ne ait CD'nin içinde, gizli ibareli 'Andıç' ile 'Siyasal İslam'la Mücadele' ve 'Karanlık Savaş Konsepti 2' başlıklı dokümanlar bulunuyor. Söz konusu belgelerde, terörün açıktan lanetlenmesi, ancak el altından desteklenmesi isteniyor: "Güdümlemeye müsait günlük yaşantıya, ekonomiye ve devlet idaresine karşı etkili olunabilecek kurum ve kuruluşları, basın, bankalar, borsa, haberleşme vb. gibi ele geçirmek veya buralarda etkin olmak, saygın araştırma, değerlendirme veya yayın kuruluşlarını değerlendirme, analiz ve notların tetikleyici olarak ekonomik veya siyasi kriz yaratmak, mezhep, tarikat, sivil toplum örgütleri ve aydınları destekleyip güvenilirliğini artırarak kendi maksatları için kullanmak, terörün açıktan lanetlenmesi ancak el altından desteklenmesi, insani değerler, terör ve etnik milliyetçiliğin silah olarak kullanılması. Toplum psikolojisinden istifade eden bir akım yaratmak ve desteklemek, amaç elde edilinceye kadar sürdürmek için her türlü desteği vermek."