İddianamenin ek klasörlerinde yer alan söz konusu belgeler, 2003 tarihini taşıyor. Kurum içi hazırlanmış evrakların üzerinde 'kişiye özel', 'gizli' ve 'ivedi' ibareleri dikkat çekiyor. Buna göre Eruygur, İstanbul, İzmir, Adana, Diyarbakır ve Trabzon'un aralarında bulunduğu 21 ilin jandarma komutanlığına örnek çizelge göndererek araştırma yapılmasını istemiş. Çizelgede, 'caminin kapasitesi', 'vakit namazlarına gelen kişi sayısı', 'cuma namazlarına gelen kişi sayısı ve doluluk oranı' şeklinde başlıklar bulunuyor. Genelkurmay Başkanlığı'nın 26 Haziran 2003 tarihli Korgeneral H.K. imzalı tek sayfalık emir yazısında, Türkiye genelindeki mevcut camilerin kullanım kapasitelerini tespit etmek maksadıyla bir çalışma başlatıldığı ifade ediliyor. Ekte gönderilen çizelgeye göre hazırlanacak bilgilerin 17 Temmuz 2003'e kadar Jandarma Genel Komutanlığı'na gönderilmesi isteniyor. Konunun bazı çevrelerce istismar edilmesini önlemek maksadıyla incelemenin sorgulamadan ziyade gözleme dayandırılarak bilmesi gereken prensibine göre yapılmasının sağlanması emri veriliyor. Yazının ekinde yer alan 2 Temmuz 2003 tarihli ve 'J.Bnb. M.A.' imzalı örnek çizelgede, "Caminin adı, kapasitesi, vakit namazlarına gelen kişi sayısı, cuma namazlarında caminin doluluk oranı (%)" başlıklarının altına gerekli bilgilerin yazılması emri veriliyor.