Yanardağ, PKK katliamlarının en üst seviyede olduğu 1991-1992 yılları arasında terör örgütünün propagandasını yapan Özgür Gündem'de haberlerin mutfağında etkin isimdi. Kendisini savunurken 'Çizgimde değişiklik yok.' diyen Yanardağ'ın yönettiği gazetede, devlete, askere, polise ağır hakaretler yer alıyor. O dönemde gazete hakkında çok sayıda dava açılmış. Yanardağ bugün ulusalcı kitlelere yönelik yayınları ile tanınan Kanaltürk Televizyonu'nun sahibi Tuncay Özkan ile birlikte hareket ediyor. Televizyonun yayın kurulunda görev yapan Yanardağ, Özkan'ın sağ kolu olarak kabul ediliyor. Özgür Gündem'in PKK'nın lehine yazdığı bazı haberler: 2 Kasım 1992: PKK lideri Öcalan, BBC'ye "Samimi ateşkese hazırız." dedi. 2 Kasım 1992: Polisin işkencede ölüme bahanesi çok. 6 Kasım 1992: PKK Genel Sekreteri Öcalan: K. Irak harekâtı dolaylı işgaldir. 9 Kasım 1992: Önceki gün 4 saat top ve tank ateşine tutulan kentte 7 kişi öldü. 9 Kasım 1992: Tunceli'de oğlu dağa çıkan ailenin evini yaktılar. 16 Kasım 1992: Kürtçe konuşan askere polis dayağı. Özgür Gündem gazetesi bölücü terör örgütü PKK'nın ülkemizdeki propaganda çalışmalarında önemli bir yere sahip. 1990'lı yılların başından bu yana bebek katili terör örgütüne destek veren Özgür Gündem gazetesi, mahkemeler tarafından sık sık kapatılsa da değişik isimlerle yayın hayatını sürdürdü. Gazetede bölücü terör örgütü başı Abdullah Öcalan, bir liderden bahsedilir gibi anılırdı. Güneydoğu'da öldürülen teröristler için de gazete sayfalarında taziye ilanları yayınlanıyordu. O zamanlar devrimci bugün ise ulusalcı olan Yanardağ'ın, kuruluşunda bulunduğu gazete son olarak Ülkede Özgür Gündem adıyla yayın hayatındaydı. Büyükanıt'ın Özgür Gündem tepkisi Genelkurmay Başkanı Orgeneral Yaşar Büyükanıt, 10 Kasım 2006'da Gazi Orduevi'nde düzenlediği basın kokteyli'nde, Ülkede Özgür Gündem gazetesinin zararlı faaliyetlerine dikkat çekerek, "PKK'nın dergileri ve günlük gazeteleri yayımlanıyor.Bunlara müsaade edilmemesi gerek." şeklinde açıklamada bulunmuştu. Açıklamadan sonra gazetenin yayını 16 Kasım 2006 tarihinde İstanbul 10. Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararıyla 15 gün süreyle durduruldu. Merdan Yanardağ, Kanaltürk televizyonunun internet sitesine yaptığı açıklamada kendini savundu. Genelkurmay Başkanı Orgeneral Büyükanıt'ın rahatsızlığını açıkça dile getirdiği söz konusu gazeteyi Yanardağ, "Özgür Gündem, yasalar çerçevesinde çıkan; bütün eksikliklerine karşın birlik, kardeşlik ve barış ilkelerini savunan ve bu yönde yayın yapan bir gazeteydi." diye savundu. Terörle mücadelenin etkin olarak yaşandığı 1990'lı yıllarda Jandarma Asayiş Bölge Komutanlığı yapan emekli Korgeneral Hasan Kundakçı, Özgür Gündem için, "Gazete psikolojik savaş yapıyordu. O dönemin vali ve emniyet müdürlükleri gerekli önlemleri alıyordu. Biz de zaman zaman bu yayın organının faaliyetlerini gerekli yerlere bildiriyorduk." diyor. ZAMAN