Aynı iddiaya göre, şifreli dosyalardan "Cumhuriyet Gazetesi Ankara Temsilcisi Mustafa Balbay'ın yabancı istihbarat örgütleriyle yazıştığı ve bilgi aktardığına dair" belgeler çıktığı ileri sürülüyor... Balbay'a ait bilgisayardan Genelkurmay Başkanlığı'na ait ve sadece Genelkurmay'da olması gereken çok gizli belgelerin çıktığı iddia ediliyor. Ve yine bilgisiyarda yapılan çok detaylı incelemelerde, Balbay'ın sildiğini düşündüğü dosyalar ve yazışmalara da ulaşıldığı öne sürüldü. Söz konusu belgeler arasında Balbay'ın, Ergenekon Terör Örgütü iddiaları kapsamında yakalanan kişilerle, Türkiye'de askeri darbe yapılmasını sağlamak için yaptığı konuşma ve yazışmalar olduğu iddia edildi. Balbay'ın konuyla ilgili soruya "ben bunları bilgisayarımdan silmiştim" dediği ileri sürüldü. Balbay'ın şifreli bilgisayarından bin sayfaya yakın bilgi ve belge çıktığı iddia ediliyor.