Adalet Bakanı’nın Hâkimler ve Savcılar Yüksek Kurulu’ndaki ‘görev ve yetkilerini’ düzenleyen madde, AK Parti’nin verdiği önerge ile değiştirilerek kabul edildi. Buna göre hakim ve savcılar hakkında soruşturma açma yetkisi olan adalet bakanına, ‘soruşturma açmama’ yetkisi de verildi. HSYK’daki ilgili dairenin teklifi üzerine hakim ve savcılar hakkında denetim, araştırma, inceleme ve soruşturma yapılmasına ‘olur’ veren adalet bakanı, ‘araştırma, inceleme ve soruşturma yapılmasına yer olmadığına ilişkin işlemlere’ de olur verecek. Mevcut kanuna göre soruşturma izinleri bakana gelirken, soruşturmaya gerek olmadığına dair kararlar bakana götürülmüyor. Komisyondan geçen maddeye göre halen HSYK Genel Kurulu’nun atadığı, Teftiş Kurulu başkanını, teftiş kurulu başkan yardımcılarını, genel sekreter yardımcılarını artık bakan atayacak. Yine HSYK’nın yetkisinde olan yönetmelik ve genelge çıkarma yetkisine de bakan sahip olacak.

HSYK üyeleri hakkındaki suç soruşturması ile disiplin soruşturması ve kovuşturma işlemlerini adalet bakanı başlatacak. Kanun teklifinde öngörülen, kurul üyeleri ile ilgili yapılacak soruşturmanın sonucunda kararı da bakanın vermesi uygulamasından vazgeçildi. Komisyonda kabul edilen teklife göre kurul üyelerinin soruşturmalarını bakan başlatacak, ancak son kararı HSYK Genel Kurulu verecek. Ayrıca kanun teklifinde adalet bakanının disiplin işlemleriyle ilgili Genel Kurul toplantılarına katılma yasağını kaldıran maddeden de vazgeçildi. Anayasa’ya açıkça aykırı olduğu için vazgeçilen düzenleme sonrasında bakan, mevcut durumdaki gibi disiplin işlemleriyle ilgili Genel Kurul toplantılarına ve dairelerin çalışmalarına katılamayacak.