TCDD, Ankara-İstanbul hızlı tren projesi 1'inci etap 3 numaralı viyadük yapımına zaman aralığı sağlamak üzere 30 Eylül - 17 Ekim 2006 tarihleri arasında Ankara-Eskişehir arasında bazı trenler işletilemeyecek. TCDD'den yapılan açıklamada, Beylikköprü ve Sazak trafo merkezlerindeki çalışma ile Ankara-İstanbul hızlı tren projesi 1'inci etap 3 numaralı viyadük yapımına zaman aralığı sağlamak amacıyla 30 Eylül - 17 Ekim 2006 tarihleri arasında Ankara-Eskişehir arasında bazı trenlerin işletilemeyeceğini, bazı trenlerde de dizel işletmeciliği yapılacağı bildirildi. Açıklamaya göre, Ankara - Eskişehir ve Eskişehir - Ankara hattında; Boğaziçi, Başkent ve Cumhuriyet Ekspres trenleri işletilmeyecek. Bu trenler, Eskişehir - Haydarpaşa, Haydarpaşa - Eskişehir arasında sefer yapacak. Diğer ekspres trenler; Doğu, Güney-Vangölü, İzmir Mavi, Karesi, 9 Eylül, Anadolu, Ankara, Fatih, Transasya Ekspres trenleri normal seferlerine devam ederek, Ankara - Eskişehir, Eskişehir - Ankara arasında dizelle işletilecek. 18 Ekim 2006 tarihinde; Ankara - Eskişehir, Eskişehir - Ankara arasında Başkent Ekspres sefer yapmayacak. Aynı gün Cumhuriyet ve Boğaziçi Ekspres trenleri Ankara - Haydarpaşa hattındaki seferlere başlayacak.