Ferda Paksüt'ün iddianamede 'örgüt yöneticisi' olarak sayılan, 12 isimden biri olduğu iddia edildi. Ferda Paksüt'ün ismi aynı soruşturmanın firari şüphelilerinden eski milletvekili Turhan Çömez'le yaptığı görüşmelerin dinlemeye takılmasıyla gündeme gelmişti. Paksüt'ün, AK Parti hakkındaki kapatılma davası sürecinde Çömez'le görüşmeler yaptığı belirlenmişti. Kamuoyunda dinleme tartışmalarının yapıldığı bu süreç Ergenekon savcılarının talimatı sonucu Paksüt'ün ifadesinin alınmasıyla son bulmuştu. Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı, 28 Ağustos 2008'de Paksüt'ün Ergenekon soruşturması kapsamında şüpheli olarak 6 saat ifadesini almıştı. Ayrıca, Anayasa MahkemesiBaşkan Vekili Osman Paksüt, eşi Ferda Paksüt ve Turhan Çömez'in Ankara'da Tenis Kulübü'nde bir araya geldikleri de ortaya çıkmıştı.ZAMAN