Toplumun bütün kesimlerinde infial uyandıran açıklamalar, kanaat önderleri, sivil toplum kuruluşları ve resmi yetkililerce dile getirildi. Papa'nın yaptığı açıklamalara çok sert tepki gösteren Diyanet İşleri Başkanı Ali Bardakoğlu, "Büyük gaf ve küstahlık" diye konuştu. Papa'nın açıklamalarını ZAMAN'a değerlendiren Bardakoğlu, "Herhalde yaptığı büyük gahı, saygısızlığı, küstahlığı görerek yaptığından utanacak ve özür dileyecektir. Eğer kilise adamı değilde din adamı ise bunu yapacak, çıkıp özür dileyecektir." dedi. Aklı selim sahibi Hiristiyan din adamlarına da çağrıda bulunan Bardakoğlu, Papa'nın sözlerinin düşmanca ve kışkırtıcı olduğunu, dünya barışı sarstığını açıklamalarını istedi. Bu sözleri söylen bir insanın barıştan, diyalogdan, hoşgörüden söz etmemesi gerektiğini anlatan Diyanet İşleri Başkanı, "Papa kin ve nefret arıyorsa, akıl dışılık arıyorsa kilisenin yapıp ettiklerine baksın. Kin, göz yaşı ve nefret arıyorsa Hristiyanlığın tarihine göz atsın" ifadelerini kullandı. Bardakoğlu, "Eğer özür dilemeyecekse, bu düşünceleri içindeki kinin, nefretin yansıması ise bir daha sevgi sözcüğünü ağzına almasın. Diyalogdan, barıştan söz etmesin. Böylekonuşmaya devam ederse de beni şaşırtmaz." diye konuştu. Papa'nın yaptığının din adamı tavrı olmadığını, kışkırtıcı siyaset adamı tavrı olduğunu söyledi. Açıklamaları 'önyargılı', 'kışkırtıcı' ve 'düşmanca' olarak niteleyen Bardakoğlu, Müslümanlara karşı tarihten gelen nefretin devam ettiğini belirtti. Açıklamaların İslam düşmanlığının yansımalara olduğunu anlattı. Ali Bardakoğlu, 16. Benediktus'un sözlerini Batı'nın şımarık ve ukala tavrının tekrarı olarak gördüğünü dile getirdi. Papa'nın ifadelerini insanlığın ortak barışı için son derece talihsiz bulduğunu kaydeden Diyanet İşleri Başkanı, Papa'dan sözlerini acilen geri almasını ve özür dilemesini istedi. Papa'nın yaptığı açıklamaları haçlı zihniyetinin yansımaları olarak değerlendiren Bardakoğlu, Batı'nın İslama karşı öngaryısının objektif değerlerdirme yapan Batılı bilim adamları tarafından da tespit edildiğini aktardı. Söylenen sözleri eleştiri olarak nitelemenin mümkün olmayacağına da vurgu yapan Diyanet İşleri Başkanı, "Eleştiriye açığız. Yanlışlar söylenebilir. Ama İslam'ın kutsallarına dil uzatılmamalı. Tıpkı bizim Hz. İsa'ya asla dil uzatmadığımız gibi." dedi. Papa'nın önümüzdeki aylarda Türkiye'yi ziyaret edeceğini de hatırlatarak, "İslam peygamberine bu şekilde hakeret eden birinin yapacağı gezinin bir sonuç doğuracağını düşünmüyorum. Bu düşüncelerle Türkiye'ye gelmesinin yararı yok." diye konuştu. Papa'nın "İslam'la akıl arasında bağ yok" sözlerini de esefle karşıladığını dile getiren Ali Bardakoğlu, "Onlar önce üç tanrı inancını izah etsinler. Hz. İsa'nın Allah'ın oğlu olduğunu iddia etmenin neresi akılcı." dedi. Kilisenin Hiristiyanlığı tahrip ederek akıl dışı unsurlar eklediğini anlatan Bardakoğlu, Batı'da insanların dine karşı mesafeli durmasını temelinde de kilisenin bu tahribatının yattığını söyledi. İslam dünyasının soğuk kanlılığını da korumasını isteyen Bardakoğlu, kesinlikle bir şiddet eylemine tevessül edilmemesini istedi. Bu hakeretlere akılla, sağduyu ile cevap verilmesinin önemine vurgu yapan Bardakoğlu, "İslam dünayısını soğuk kanlılığını korumalı. Hiçbir duygusal tepki, kışkırtıcı açıklamaya prim verilmemeli. Hristiyanlarla müslümanların farkı budur. Biz şiddet prim vermemeliyiz. İftira kampanyasına hep sürüyor. Önce karikatür krizi, ardında bu. Ancak müslümanlar akılla vakarla cevap vermelidir. Bizim geleneğimizde asla Hristiyanların kutsalına dil uzatılması yoktur. İsa bizim de peygaberimiz." dedi. Papa'nın açıklamalarına sivil toplum kuruluşlarından da sert tepki geldi. 16. Benediktus'un sözlerini 'iftira' olarak niteleyen Memur-Sen Genel Başkanı Ahmet Aksu, dünyanın barışa ihtiyacının duyduğu bir dönemde yapılan bu açıklamalarını dinler arasında nefret doğuracağını ve şiddeti artıracağını söyledi. Aksu, Papa'nın sözleri için "Bir din adamına yakışmayacak derecede cahilce ve bağnazca." ifadelerini kullandı. Savaşlar nedeniyle dünyanın kan gölüne döndüğüne işaret eden Aksu, kin ve nefreti körükleyecek sözler sarf etmesinin hiç kimseye yarar getirmeyeceğini ifade etti. Aksu, Papa'nın, Ortaçağ zihniyetinin karanlık düşüncelerini 21. yüzyılda tekrarlayarak, Ortaçağ karanlığını ve barbarlığını tekrar dünyaya yaymak istediğine söyledi. Ahmet Aksu, "Papa'nın İslam hakkında gerekli bilgi ve donanıma sahip olmadığı görülüyor. Bunun için Sayın Papa'ya bir an önce Kur'an'ı Kerim, Mevlana, Yunus, Hacı Bektaşi Veli okumasını tavsiye ediyoruz. Papa bunları okursa, İslam'ın diğer dinlere karşı gösterdiği engin hoşgörü karşısında utanacak ve Müslümanlardan özür dileyecektir." ifadelerini kullandı. Sağlık-İş Başkanı Mutafa Başoğlu da Paya'ya sert tepki gösterdi. 'Papa tam anlamıyla saçmalamıştır' diyen Başoğlu, " Bu kafayla Türkiye'ye gelmesin. Gelirse Müslümen Türk milleti tarafından hoş karşılanmayacağını bilmelidir." şeklinde konuştu.