Kişisel Twitter hesabında yaptığı paylaşımda, "Şu an Artuklu Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Ahmet Ağırakça'yı 90'lı yıllardan çok iyi tanırım. "Demokrasi şirktir, oy vermek küfürdür" ekolünden yani IŞİD kafalı. O şimdi "düzenin rektörü”!” diyen Eliaçık, şu soruyu da yöneltti: "Hala Tayyip kafir, tağuti düzenle hükmediyor diyor mu acaba?”